Es el conjunto de microrganismos que hacen vida de manera normal dentro de organismos pluricelular en un sistema u órgano determinado proporcionando beneficios a su huésped.

Es una relación simbiótica comensal en la que ambos obtienen beneficios tanto el microrganismo como el huésped. Se encuentra en muchas partes de nuestro cuerpo: nariz, boca, conducto auditivo, piel, pulmón, intestino delgado, intestino grueso, vejiga, uretra, riñones, vagina, útero, próstata, etc.